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七歳でＭＩＴの学生となった少年、桜庭聖(さくらばひじり)。
彼は翌年の誕生日に、想いを寄せていた女性から突然の別れを告げられる。
それを境(さかい)に、『記憶と記録(アーカーシック・レコード)』の研究に没頭するようになる。彼女との再会をしたいがために。
　しかし、ある事件によって日本の中学に編入することになった。アメリカへの想いを絶ち切ろうと、そして『学力の植民地化』を受けた日本での生活に馴染めないことで、苦悩の日々をおくる。
　そんな心的環境のなかで、『記憶と記録』の研究を続けるのだった。しかし、それが原因で、世界の命運を左右する立場になってしまい……。